Если в форму логина ввести неверные логин/пароль, то появится сообщение

Что-то не так! Вероятно, неправильно указан логин (e-mail) или пароль.

Повторно вводим логин/пароль (тоже неправильные), жмем «войти» — идет проверка, надпись в это время не исчезает, проверка заканчивается, ничего не меняется. Пользователю может стать не понятно, это он снова ошибся, или это сбой какой-то на сайте — ведь визуально для него ничего не поменялось.
Если бы при повторном нажатии на «войти» сообщение исчезало и снова появлялось после окончания проверки, стало бы более понятно.
В файле \engine\lib\internal\template\js\user.js на 387 сообщение об ошибке убирается после возврата ответа функцией ls.ajaxSubmit.
Можно просто поправить файл user.js, перенеся всю конструкцию

if (typeof(form)=='string') {
    form=$('#'+form);
}
form.find('.validate-error-show').removeClass('validate-error-show').addClass('validate-error-hide');

на две строчки выше, тогда надпись будет исчезать сразу после нажатия на кнопку «войти».
Но там есть хук ls.hook.marker('loginBefore'); — возможно правильнее было бы его задействовать с помощью простенького плагина, чтобы не менять код движка.