Предлагаю для каждого модуля и блока сделать собственные конфигурационные файлы.

Суть в том, что в блоках и модулях есть разные маленькие настройки, которые может сильно потребоваться изменить в проекте.

Допустим размер тегов:

$iMinSize=1; // минимальный размер шрифта
$iMaxSize=10; // максимальный размер шрифта

Или те же самые блоки в модулях:

$this->Viewer_AddBlocks('right',array('comments'));
$this->Viewer_AddBlocks('down',array('tags'));

Может быть сделать это в виде функции движка, чтобы она скажем искала файл конфига по шаблону? Например:

Блок: BlockBlogs.class.php — Конфиг: BlockBlogs.cfg.php

И если такого файла нет, то использовать значения по умолчанию.

Таким образом можно будет создать набор конфигов для своего проекта, который будет задавать основные настройки. Обновление проекта будет делать значительно проще.