Потратил кучу времени на решение проблемы, а именно письма-оповещения с сайта попадали в СПАМ, особенно остро стояла проблема с Google. На данный момент я смог побороть этот недуг и хочу поделиться с вами своим решением.



Дисклеймер
Почта и домен работают через Яндекс, но думаю решение поможет и тем, кто хочет напрямую через свой сервер гонять.

1. Убедитесь, что IP хостера, где находится ваш сайт нет в СПАМ-базах.
Проверить это можно сделать: xseo.in/dnsbl и ru.smart-ip.net/spam-check
Если IP в базе нет, то действуйте дальше, если есть стучите хостеру, пусть решает проблему.

2. Настройка DKIM и SPF, важно и нужно. Если вы будите гонять почту через Яндекс, Google или Mail.ru, то они предоставят вам всю инфу и вы в панели управления, сможете без труда прикрутить DKIM и SPF. Если же гоняете через свой севрер, то DKIM можно сгенерировать тут: dkimcore.org/tools/keys.html дальше по всё тем же инструкциям прикручиваете его.
Что делать с SPF читаем тут: habrahabr.ru/post/143951/ про DKIM там тоже есть.

3. Настраиваем class.phpmailer.php (/engine/lib/external/phpMailer/). В принципе, если 1 и 2 выполнены грамотно, то можно его не трогать, но если хотите, чтоб всё было красиво, то идём в него.
Начиная с 281 по 308 строчку, вам надо кое что дополнить:

 /**
   * Used with DKIM DNS Resource Record
   * @var string
   */
  public $DKIM_selector   = 'default';

  /**
   * Used with DKIM DNS Resource Record
   * optional, in format of email address 'you@yourdomain.com'
   * @var string
   */
  public $DKIM_identity   = 'email@name-domain.ru';

  /**
   * Used with DKIM DNS Resource Record
   * @var string
   */
  public $DKIM_passphrase   = 'если есть, генератор его не даёт, можно оставить пустым';

  /**
   * Used with DKIM DNS Resource Record
   * optional, in format of email address 'you@yourdomain.com'
   * @var string
   */
  public $DKIM_domain     = 'name-domain.ru';

  /**
   * Used with DKIM DNS Resource Record
   * optional, in format of email address 'you@yourdomain.com'
   * @var string
   */
  public $DKIM_private    = 'DKIM ключ который вы сгенерировали для домена ';

В заключение, я поменял метод кодирования с 8bit на base64 в 69 строке. Мне он больше нравится.

P.S.: ЗАБЫЛ!
Рекомендую создать отдельный почтовый адрес для таких рассылок noreply@name-domain.ru
Затем поменять шаблоны авто-писем (/templates/skin/шаблон/notify/russian), убрать лишние ссылки и привести их к общим требованиям Google, да и других ПС/почтовых служб support.google.com/mail/answer/81126?hl=ru

P.P.S: ДОПОЛНЕНИЯ

• habrahabr.ru/company/yandex/blog/189032/ — Яндекс.Почта для домена, настройка
• habrahabr.ru/post/106589/ — DKIM — это просто (общая суть)

Никто не пытался обновить PHPMailer до актуальной версии? github.com/Synchro/PHPMailer/

Все эти методики не дадут и 50% гарантии попадания писем в inbox, так как у Google, да и многих других сервисов есть важные требования: отписка в 1-2 клика прямо из письма, List-Unsubscribe и т.д. Жду ваши методики, как не стать спамером :)

Надеюсь, щас придут специалисты и меня поправят, где я не прав.